司法行政机关主要包括以下机构：
中华人民共和国司法部：
作为中央司法行政机关，负责全国范围内的司法行政管理工作。
地方司法厅：
各级地方政府下属的司法行政部门，负责本行政区域内的司法行政管理工作。
司法局：
地方各级政府的司法行政机关，执行上级司法行政机关的决策，管理本地的司法行政事务。
司法行政机关的主要职责包括：
监督和指导全国监狱执行刑罚、改造罪犯的工作。
监督和指导全国劳动教养工作。
制定全国法制宣传教育和普及法律常识规划并组织实施。
指导和检查各地区、各行业的依法治理工作。
监督和指导全国的律师工作和法律顾问工作。
司法行政机关确保国家法律权威性和行政效率，维护国家社会稳定和法治秩序