股东持股比例通常是通过以下步骤来计算的：
1. 确定股东出资额：这是股东投入公司的资金总额。
2. 确定注册资本金：这是公司成立时股东们共同认缴的资本总额。
3. 计算持股比例：将股东的出资额除以注册资本金，然后乘以100%得到持股比例。
例如，如果一个公司的注册资本金为90万元，某股东出资10万元，则该股东的持股比例计算如下：
```
持股比例 = 出资额 / 注册资本金 × 100%
= 10万元 / 90万元 × 100%
= 10%
```
这意味着该股东持有公司10%的股份。
需要注意的是，实际计算持股比例时，可能还需要考虑其他因素，如股份的溢价、股票数量、公司发行的总股票数等。此外，公司章程和股东会决议中可能对股权分配有特别规定，应遵循这些规定进行计算。