查询合作医疗账户余额的方法有以下几种：
网络查询
登录当地农村合作医疗网站，首页通常会有“个人账户查询”或类似入口。输入个人医疗证号与姓名，即可查询账户余额。
使用国家医保服务平台APP，注册登录后，在个人账户页面即可查看余额信息。
电话查询
拨打全国统一社保服务热线12333，按语音提示输入相关信息，账户余额会即刻呈现。
也可以拨打当地社保中心或农村合作医疗管理机构的咨询电话，电话号码通常可在官方网站上找到。
现场查询
携带个人身份证等有效证件，亲临当地社保中心或农村合作医疗管理机构。工作人员协助或通过自助查询机查询账户余额。
定点药店或医院查询
在定点药店购药或咨询时，可向工作人员询问新农合个人账户余额。
在定点医院就医时，出示医保卡证明参保身份，在挂号或住院报销时查询账户余额。
建议选择最便捷的查询方式，如网络查询或电话查询，以便随时随地了解账户余额情况。