商业用地过户需要支付的费用主要包括以下几项：
契税：
根据房屋成交价格或评估价的3%征收，具体税率根据当地规定可能有所不同。
个人所得税：
如果持有房产不满五年，需缴纳房产交易盈利部分的20%或房款的1%。若持有房产满五年且为唯一住房，则可以免除个人所得税。
印花税：
按照房屋成交价格或评估价的0.1%征收。
增值税：
如果持有房产不满两年，需缴纳5.6%的增值税及相应的城建税、教育附加和地方教育附加税。
房屋交易手续费：
一般为房屋建筑面积乘以每平米3元。
房屋产权登记费：
一般为200元内。
土地增值税：
根据具体情况计算，若无法提供上手购房发票，则按照转让收入的30%-40%征收土地出让金后，再计算土地增值税。
需要注意的是，上述费用标准可能因地区和具体情况有所不同，建议在办理商业用地过户时咨询当地房地产管理部门或专业律师以获取最准确的税费信息。