发票抬头不同可能有以下几种原因：
发票抬头有错误：
例如，单位名称为“国营XX”，但开票方将其写成了“囯营XX”。这种情况下，需要仔细检查发票信息，确保抬头完全正确。
单位正确的发票抬头没有维护：
如果确认发票上单位名称和税号是完全正确的，则可以不用理会，直接提交就行。但建议在上传前将所有正确的发票抬头信息先录入系统，以避免未发现的问题。
原件格式问题：
主要出现在员工或财务人员上传电子发票自动识别时，由于电子识别技术的局限性，可能会将其中个别字识别错误，导致识别的信息与票面显示的信息不一致。这种情况下，请检查发票票面的抬头，如果确认发票上的抬头是正确的，可以忽略这个提醒。
合同签订方与发票抬头不一致：
如果发票抬头和合同的签订方名称不相符合，不管是开具发票的单位还是收取发票的单位的会计做帐都不符合规定。出现这样的情况，可以将发票作废重新开，也可以将合同重新签订。
发票类型不同：
根据购买者的不同，发票抬头也有所区别。例如，商业发票的抬头是买方，即收货人的名称或者收货方的单位名称；海运提单的抬头是收货人，即买方；汇票有限制性抬头、指示性抬头、持票人抬头等；支票的抬头是收款人或者收款单位名称；信用证则不讲抬头，只讲受益人和开证人。
购买者不同：
发票抬头还可以指购物人名称，如自己购买就写自己的名字，如单位购买，报销，就写单位名称。这种区分主要是为了确定发票的使用场景和报销资格。
总结来说，发票抬头不同可能是由于输入错误、系统维护不当、识别技术问题、合同与发票不一致、发票类型差异或购买者不同等原因造成的。确保发票抬头正确无误，有助于合规性和财务管理的顺利进行。